การไม่มีประจำเดือนเป็นเวลาสามเดือนหรือมากกว่านั้นเรียกว่าภาวะขาดประจำเดือนแบบทุติยภูมิ สิ่งนี้สามารถเกิดขึ้นได้จากหลายสาเหตุ สาเหตุตามธรรมชาติของการไม่มีประจำเดือนเป็นเวลาสามเดือน ได้แก่ วัยหมดประจำเดือน การตั้งครรภ์ และการให้นมบุตร ปัจจัยในการดำเนินชีวิตบางอย่าง เช่น ความเครียดและการออกกำลังกายมากเกินไปก็อาจเป็นสาเหตุได้เช่นกัน นอกจากนี้ การมีไขมันในร่างกายมากเกินไปหรือต่ำเกินไปก็อาจทำให้ ประจําเดือนไม่มา ได้เช่นกัน เนื้องอกในต่อมใต้สมองหรือต่อมไทรอยด์ที่ไฮโปแอกทีฟ/ไฮเปอร์แอคทีฟสามารถนำไปสู่ความไม่สมดุลของฮอร์โมนและกระตุ้นให้เกิดภาวะขาดประจำเดือนได้ ระดับฮอร์โมนเอสโตรเจนต่ำหรือระดับฮอร์โมนเทสโทสเตอโรนสูงอาจส่งผลให้ประจำเดือนขาดได้